เนื้อเรื่องของหนังตอน Fight the Future นั้นเท่าที่ดูแล้วน่าจะเหมือนกับเป็นเหตุการณ์ที่แฟ้มคดี X ถูกปิดลงแล้วได้เกิดเหตุการณ์ขู่วางระเบิดในตึกหน่วยงานราชการ แล้วนักสืบ Fox Mulder ซึ่งรับบทโดย David Duchovny กับนักสืบคู่หูอย่าง Dana Scully รับโดย Gillian Anderson ก็ได้ค้นพบระเบิด แต่เหตุการณ์ไม่คลาดคิดคือเหตุการณ์ระเบิดนั้นทำให้ทั้ง 2 ได้กลับไปเจอเรื่องลึกลับอีกครั้ง เรื่องที่คนในระดับสูงของรัฐบาลพยายามปิดบังเอาไว้มาเป็นเวลานานหลายสิบปี ทั้ง 2 คนจึงได้ออกสืบหาข้อเท็จจริงของเหตุการณ์ที่พบเจอ
จนกระทั่งไปพบเหตุการณ์ไม่นึกถึง การแพร่ระบาดของไวรัสจากนอกโลกที่อยู่บนโลกมานานแสนนาน แล้วหน่วยงานของรัฐระดับสูงพยายามที่จะวิจัยและหาประโยชน์จากมันทั้งที่ไม่สามารถควบคุมมันได้ เหตุการณ์ได้นำพานักสือทั้งสองให้อยู่ในอันตรายเสี่ยงชีวิตมากมาย เนื้อเรื่องจึงมีความสนุกเหมือนกับเอาหนังซีรียส์เรื่องนี้มาบีบรวมกันให้กลายเป็นหนัง the movie ในภาคที่ชื่อว่า The X-Files: Fight the Future (ฝ่าวิกฤตสู้กับอนาคต)