กระบี่ไร้เทียมทาน มีโครงเรื่องหลักอยู่ที่ความขัดแย้งอันยาวนานระหว่างสำนักบู๊ตึ้งกับ “สำนักบ้อเต็ก” สำนักมารอันดับแห่งตามท้องเรื่อง ที่แค้นเคืองกันด้วยประวัติศาสตร์ระหว่างสองสำนัก และยังเป็นความแค้นเคืองส่วนตัวระหว่างเจ้าสำนักคนปัจจุบันของทั้งสองสำนักด้วย